Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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