Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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