Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd180Q62192 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd180Q62192 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms