Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Odf1Q61999 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Odf1Q61999 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Odf1Q61999 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Odf1Q61999 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Odf1Q61999 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Odf1Q61999 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Odf1Q61999 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Odf1Q61999 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Odf1Q61999 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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