Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms