Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Foxd1Q61345 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Foxd1Q61345 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Foxd1Q61345 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Foxd1Q61345 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Foxd1Q61345 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Foxd1Q61345 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Foxd1Q61345 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Foxd1Q61345 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Foxd1Q61345 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Foxd1Q61345 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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