Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4Q61107 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms