Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ncor1Q60974 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms