Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms