Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf15Q5UBV8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms