Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trim38Q5SZ99 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trim38Q5SZ99 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trim38Q5SZ99 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trim38Q5SZ99 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trim38Q5SZ99 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trim38Q5SZ99 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trim38Q5SZ99 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trim38Q5SZ99 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trim38Q5SZ99 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trim38Q5SZ99 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trim38Q5SZ99 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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