Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brip1Q5SXJ3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms