Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc42Q5SV66 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms