Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim41Q5NCC3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms