Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms