Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms