Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacs2Q3V3Q7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pacs2Q3V3Q7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pacs2Q3V3Q7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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