Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms