Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms