Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms