Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrch2Q3UMG5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms