Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitpnm3Q3UHE1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitpnm3Q3UHE1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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