Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms