Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hddc2Q3SXD3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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