Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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