Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms