Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cers3Q1A3B0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms