Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms