Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms