Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms