Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms