Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms