Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cxcr5Q04683 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cxcr5Q04683 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cxcr5Q04683 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcr5Q04683 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cxcr5Q04683 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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