Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sec23aQ01405 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms