Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgcrQ01237 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms