Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelpQ01102 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms