Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms