Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tp53bp1P70399 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tp53bp1P70399 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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