Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprvP70289 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprvP70289 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprvP70289 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprvP70289 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms