Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms