Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PlnP61014 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms