Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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