Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms