Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms