Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms