Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms