Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a1P55014 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a1P55014 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms