Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn5P54830 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn5P54830 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms