Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CnbpP53996 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms