Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RorcP51450 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms